Juno được phóng từ Cape Canaveral vào tháng 8 năm 2011 và đi vào quỹ đạo ổn định quanh sao Mộc 5 năm sau đó. Hai tháng đầu thiết bị tìm cách hạ độ cao của quỹ đạo và kiểm tra lại các công cụ khoa học, các dữ liệu đầu tiên bắt đầu nhận được vào cuối tháng 8 năm ngoái.
Trạm tiến gần tới sao Mộc 53 ngày một lần. Tháng 10 năm 2016 Juno bay cách lớp trên của khí quyển sao Mộc chỉ 10.000 km và thu được những thông tin mới về cấu trúc lõi sao Mộc và cực quang bí ẩn ở hai cực.