Các chuyên gia trong hơn 100 năm đã tranh luận về vấn đề con người chiếm lĩnh khu vực Đông Nam Á. Trải qua nhiều năm đã hình thành hai giả thuyết chính: theo giả thuyết đầu tiên, những người săn bắn hái lượm địa phương đã xây dựng nền nông nghiệp một cách độc lập với các nước láng giềng, còn lý thuyết thứ hai khẳng định rằng họ đã được thay thế bởi nông dân trồng lúa di cư từ lãnh thổ Trung Quốc hiện nay.
Trong quá trình làm việc, các nhà nghiên cứu đã phân tích DNA chiết xuất từ nhiều mảnh xương tìm thấy ở Malaysia, Thái Lan, Việt Nam, Indonesia, Lào và Philippines. Hóa ra là sự đóng góp vào dân số hiện nay của khu vực có sự tham gia của những người săn bắn hái lượm từng xuất hiện ở đây 44.000 năm trước và những người nông dân Trung Quốc đến sau.
Tóm lại, người Việt Nam, Thái Lan và các cư dân khác của Đông Nam Á xuất phát từ bốn quần thể. Các dòng riêng biệt liên tục giao nhau và trộn lẫn, đặc biệt là trong quá trình di cư và định cư trên các đảo.