Theo dữ liệu của dịch vụ, chiếc tiêm kích Lockheed Martin F-35A Lightning II bay từ khu vực phía bắc Biển Nhật Bản, sau đó bay qua đất liền theo hướng đông, về phía nam thành phố Aomori, rồi tiếp tục chuyển hướng đông bắc. Khoảng 10 giờ 09 phút theo giờ Hà Nội, máy bay đã biến mất khỏi radar.
Theo thông tin về máy bay do Flightradar24 cung cấp, tại một thời điểm, chiếc F-35A đã phát mã tín hiệu 7700, mã chung dùng để báo hiệu tình trạng khẩn cấp.