Không ai trong số hơn 30 ứng cử viên ở vòng đầu tiên nhận được 2/3 số phiếu cần thiết để bầu vào chức vụ tổng thống. Người dẫn đầu vòng bỏ phiếu đầu tiên là người đứng đầu Khu tự trị Puntland, Said Abdullahi Deni, nhận được 65 phiếu bầu. Vị trí thứ hai là Tổng thống đương nhiệm của đất nước Mohamed Abullahi Mohamed, người cóphiếu từ 59 đại biểu.
Việc bỏ phiếu diễn ra trong nhà chứa máy bay ở thủ đô Mogadishu của Somalia, nơi được đặt dưới sự bảo vệ của các lực lượng thuộc Phái bộ Chuyển tiếp Liên minh châu Phi tại Somalia (ATMIS). Các phương tiện truyền thông viết rằng vào ngày Chủ nhật, sân bay đã bị bắn đạn cối.
Somalia không còn tồn tại như một quốc gia thống nhất vào năm 1991 với sự sụp đổ của chế độ độc tài Siad Barre. Cộng đồng quốc tế công nhận cơ quan hợp pháp duy nhất trong nước là chính phủ liên bang, kiểm soát thủ đô Mogadishu và một số khu vực khác. Các phần còn lại của Somalia nằm dưới sự kiểm soát của các thực thể nhà nước chưa được công nhận hoặc là các lãnh thổ tự quản.
Đặc biệt, Cộng hòa Somaliland chưa được công nhận nằm ở phía bắc của đất nước, và khu vực Puntland, nơi tuyên bố tự trị vào năm 1998, nằm ở phần phía đông.