Cùng tội danh, viện kiểm sát truy tố hàng loạt cựu lãnh đạo tỉnh Lào Cai gồm: Doãn Văn Hưởng, cựu chủ tịch UBND tỉnh; Nguyễn Thanh Dương và Lê Ngọc Hưng (đều là cựu Phó chủ tịch tỉnh); Mai Đình Định, cựu Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường; Phan Văn Cương, cựu Phó giám đốc Sở Công Thương…
7 người ở Công ty Apatit Việt Nam gồm: Nguyễn Quang Huy (cựu Tổng giám đốc); Phạm Cao Khiêm (cựu Phó tổng giám đốc); Nguyễn Ngọc Bích (cựu Chủ tịch Hội đồng thành viên)… bị truy tố tội vi phạm quy định về nghiên cứu, thăm dò, khai thác tài nguyên.
Riêng ông Nguyễn Mạnh Thừa, giám đốc Công ty Lilama, bị truy tố 2 tội là rửa tiền và vi phạm quy định về nghiên cứu, thăm dò, khai thác tài nguyên.
Về nội dung bản kết luận điều tra bổ sung nêu về hậu quả, vai trò, và tình tiết tăng hoặc giảm nhẹ của các bị can được mô tả như sau, ông Nguyễn Văn Vịnh khi còn là Phó chủ tịch tỉnh giai đoạn 2012-2015, chịu trách nhiệm về công tác quản lý và bảo vệ tài nguyên khoáng sản trên địa bàn.
Tuy nhiên, quá trình thực thi công vụ, ông Nguyễn Văn Vịnh đã có nhiều chỉ đạo, ký nhiều văn bản, giấy chứng nhận đầu tư bị cho là trái quy định pháp luật tạo điều kiện cho doanh nghiệp khai thác khoáng sản trái phép.
Ông Vịnh biết rõ diện tích 3,77ha tại thôn 2, xã Đồng Tuyển thuộc khai trường 18 đã được Bộ Công Thương phê duyệt quy hoạch quặng apatit và thẩm quyền cấp phép khai thác khoáng sản thuộc Bộ Tài nguyên và Môi trường. Nhưng vẫn ký giấy chứng nhận đầu tư cùng nhiều văn bản và tài liệu khác có liên quan không đúng thẩm quyền, trái quy định pháp luật.
Hành vi của ông Vịnh bị xác định đã tạo điều kiện cho Công ty Lilama và Công ty Apatit khai thác, tiêu thụ trái phép hơn 974 tấn quặng trong phạm vi 3,77ha.
Viện kiểm sát xác định trong công tác quản lý nhà nước thì ông Nguyễn Văn Vịnh chịu trách nhiệm chính, các cựu lãnh đạo còn lại là người thực hành.
Đáng chú ý, quá trình điều tra, ông Nguyễn Văn Vịnh và giám đốc Công ty Lilama khai nhận vào Tết Nguyên đán năm 2015, doanh nghiệp này đã đến phòng làm việc biếu quà Tết cựu bí thư 5 tỉ đồng.
Sau khi nhận 5 tỉ đồng "cảm ơn" từ doanh nghiệp, ông Nguyễn Văn Vịnh đã sử dụng chi tiêu cá nhân hết.
Hành vi của cựu bí thư cùng các cựu lãnh đạo tỉnh Lào Cai bị cáo buộc đã xâm hại đến uy tín Nhà nước, xâm phạm quyền, lợi ích hợp pháp của tổ chức, cá nhân và "gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng".
Trong quá trình điều tra bị can thành khẩn khai báo, ăn năn hối cải. Bản thân bị can đã có nhiều đóng góp cho sự phát triển kinh tế, xã hội của tỉnh Lào Cai, đã được tặng Huân chương lao động hạng nhất, hạng nhì, hạng ba; Huân chương độc lập…Chủ tịch UBND tỉnh Lào Cai tặng nhiều Bằng khen, Chiến sỹ thi đua…Đây là những tình tiết giảm nhẹ trách nhiệm hình sự, cơ quan điều tra đề nghị xem xét áp dụng khi quyết định hình phạt.