Trong vụ án này, ông Hồ Anh Sơn, cựu Thượng tá, phó Giám đốc Viện Nghiên cứu y dược học quân sự, Học viện Quân y, bị truy tố tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Ba cựu sĩ quan còn lại gồm Nguyễn Văn Hiệu, cựu Đại tá, Trưởng phòng trang bị vật tư; Ngô Anh Tuấn, cựu Thiếu tá, Trưởng phòng tài chính và Lê Trường Minh, cựu Thiếu tá, Trưởng ban hóa dược cùng bị cáo buộc tội vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng.
Hai bị cáo phía Công ty Việt Á là Phan Quốc Việt, Tổng giám đốc, bị truy tố cả hai tội danh trên; Vũ Đình Hiệp (cấp phó của Việt) bị cáo buộc tội vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng.
Liên quan vụ án, ông Trịnh Thanh Hùng, cựu Vụ phó Vụ Các ngành kinh tế - kỹ thuật, Bộ Khoa học và Công nghệ (KH&CN), bị truy tố tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Cáo trạng của Viện Kiểm sát (VKS) Quân sự Trung ương thể hiện, ngày 21/1/2020, Hồ Anh Sơn trình Thiếu tướng Hoàng Văn Lương, khi đó là Phó giám đốc Học viện Quân y, ký công văn gửi Bộ KH&CN về việc đề xuất nhiệm vụ phát triển kít chẩn đoán viêm phổi do virus Corona.
Sau khi nhận văn bản, ông Trịnh Thanh Hùng đã trao đổi, thống nhất với Phan Quốc Việt nhằm cho Việt Á tham gia đề tài. Phan Quốc Việt đồng ý.
Sau đó, ông Hùng yêu cầu Hồ Anh Sơn bổ sung Công ty Việt Á tham gia đề tài. Thực hiện ý kiến của Trịnh Thanh Hùng nên ông Sơn sửa lại phiếu đề xuất, đưa Công ty Việt Á vào để cấp trên phê duyệt trước khi chuyển đến Bộ KH&CN.
Khoảng cuối tháng 1/2020 và đầu tháng 2/2020, Hồ Thị Thanh Thủy, phó Tổng giám đốc Việt Á, vợ của Phan Quốc Việt, nghiên cứu, tối ưu từ các tài liệu do Tổ chức Y tế thế giới, Trung tâm Kiểm soát và phòng ngừa dịch bệnh Hoa Kỳ và một số nước khác công bố trên internet xây dựng quy trình sản xuất kit test.
Sau đó, Việt chỉ đạo Thủy mang kit test đi đánh giá, thử nghiệm tại Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương cho kết quả "đạt".
Ngày 3/3/2020, Hội đồng đánh giá, nghiệm thu kết quả giai đoạn 1 thông qua quy trình do Học viện Quân y nghiên cứu nhưng dựa trên kết quả đánh giá bộ kit test Công ty Việt Á cung cấp và kiến nghị Bộ Y tế xem xét cấp phép cho sử dụng để phòng, chống dịch.
Khoảng tháng 4/2020, Công ty Việt Á làm hồ sơ xin cấp phép lưu hành sản phẩm gửi Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế, Bộ Y tế.
Lần lượt vào cuối tháng 10 và 12/2021, Hội đồng nghiệm thu sản phẩm, quy trình của Học viện Quân y và hội đồng đánh giá, nghiệm thu đề tài của Bộ KH&CN đều nghiệm thu, thông qua và đánh giá kết quả đề tài ở mức "đạt".
Viện kiểm sát đánh giá, thực chất việc các hội đồng tổ chức nghiệm thu chỉ mang tính hình thức và không đúng bản chất vì sản phẩm để chứng minh cho kết quả nghiên cứu đề tài không được sản xuất theo quy trình nghiên cứu và cũng không rõ nguồn gốc, sản phẩm đã được Bộ Y tế cấp phép phục vụ phòng, chống dịch trước khi nghiệm thu Đề tài.
Theo cáo buộc của Viện Kiểm sát Quân sự Trung ương, đầu tháng 12/2020, sau khi được Bộ Y tế cấp phép, Phan Quốc Việt đã đưa bồi dưỡng ông Trịnh Thanh Hùng hai lần với tổng số tiền 350.000 USD (khoảng hơn 8 tỷ đồng).
Ngoài ra, Phan Quốc Việt chỉ đạo Vũ Đình Hiệp thông qua việc chi % tiền ngoài hợp đồng mua kit của Học viện Quân y để chia sẻ lợi nhuận đề tài cho Hồ Anh Sơn hơn 2,49 tỷ đồng.
Viện kiểm sát còn cho rằng Phó tổng giám đốc Việt Á Vũ Đình Hiệp đã chi phần trăm hoa hồng cho một số cán bộ khác của Học viện Quân y, như chi cho ông Nguyễn Văn Hiệu, cựu Trưởng phòng Trang bị - Vật tư, hơn 3,5 tỷ đồng và Ngô Anh Tuấn, cựu Trưởng phòng Tài chính, hơn 1 tỷ đồng.
Hiện các bị can đã nộp lại số tiền này.