Cáo trạng nêu rõ tháng 9/2007, UBND tỉnh Phú Yên quyết định giao 1.183 m2 đất tại lô ô phố A2 đường Hùng Vương, TP Tuy Hòa cho Công ty CP Pymepharco không qua đấu giá, thời gian sử dụng đất 70 năm. Việc giao đất này để Công ty CP Pymepharco thực hiện dự án Trung tâm Kinh doanh dược, mỹ phẩm và dịch vụ y tế Phú Yên.
Sau khi được cấp Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất, tháng 6/2008, Công ty CP Pymepharco không thực hiện dự án trên theo cam kết mà đem thế chấp vay vốn tại ngân hàng.
Đến tháng 9/2010, Công ty CP Pymepharco đem Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất trên góp vốn vào Công ty CP Xuất nhập khẩu dược Phú Yên.
Tháng 11/2012, ông Đỗ Duy Vinh - Giám đốc Sở Tài chính, ký công văn đề nghị UBND tỉnh cho phép Công ty CP Pymepharco chuyển nhượng quyền dụng thửa đất ô phố A2 cho một ngân hàng khác.
Đề nghị này được ông Phạm Đình Cự ký thông báo cho phép, với nội dung để xây trụ sở làm việc, thời hạn sử dụng đất 50 năm.
Tháng 7/2013, Pymepharco ký hợp đồng chuyển nhượng toàn bộ khu đất trên cho Ngân hàng Ngoại thương - Chi nhánh Phú Yên với giá 16 tỉ đồng.
Ông Phạm Đình Cự, lúc đó là Chủ tịch UBND tỉnh Phú Yên và ông Đỗ Duy Vinh, lúc đó là Giám đốc Sở Tài chính tỉnh Phú Yên biết Công ty Pymepharco không triển khai thực hiện dự án, thuộc trường hợp phải thu hồi đất.
Tuy nhiên, ông Cự và ông Vinh vẫn làm các thủ tục cho Công ty này chuyển nhượng quyền sử dụng diện tích đất nói trên cho Ngân hàng Ngoại thương - Chi nhánh Phú Yên vào tháng 7/2013 không đúng quy định của pháp luật.
Hành vi của 2 bị can đã gây thất thoát tài sản Nhà nước với số tiền hơn 10 tỷ đồng.