Tại phiên xét xử, đại diện viện kiểm sát đề nghị hội đồng xét xử tuyên phạt các mức án như sau:
Về tội "vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng" và "đưa hối lộ":
Bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn (cựu chủ tịch Công ty AIC): Từ 22 - 24 năm tù. Buộc bị cáo phải chấp hành chung của các bản án là 30 năm tù.
Ông Trần Mạnh Hà (phó tổng giám đốc Công ty AIC): 19 - 21 năm tù. Buộc bị cáo phải chấp hành chung của các bản án là 30 năm tù.
Ông Trần Đăng Tấn (trưởng văn phòng đại diện AIC tại TP.HCM): 18 - 20 năm tù.
Về tội "nhận hối lộ":
Ông Dương Hoa Xô (cựu giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học TP.HCM) bị đề nghị từ 15 - 16 năm tù
Về tội "lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ":
Bà Trần Thị Bình Minh (cựu phó giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư TP.HCM): 8 - 9 năm tù.
Ông Phan Tất Thắng (phó trưởng phòng kinh tế ngành, Sở Kế hoạch và Đầu tư TP.HCM): 5 - 6 năm tù.
Về tội "vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng":
Ông Nguyễn Đăng Quân (cựu giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học TP.HCM): 8 - 9 năm tù.
Ông Nguyễn Viết Thạch (cựu trưởng ban Ban quản lý đầu tư xây dựng thuộc Trung tâm Công nghệ sinh học TP.HCM): 5 - 6 năm tù.
Các ông: Nguyễn Trần Long (cựu chuyên viên Ban quản lý đầu tư xây dựng), Trần Vinh Vũ (cựu viện trưởng Viện Xây dựng và Quản trị kinh doanh tại TP.HCM), Nguyễn Minh (cựu phó tổng giám đốc Công ty Kiểm toán và Dịch vụ tin học TP.HCM), Hồ Tấn Mạnh (tổng giám đốc Công ty tư vấn và thẩm định giá Đông Nam Á), Huỳnh Tấn Vĩnh (cựu giám đốc Công ty Nguyên Châu), Đỗ Vân Trường (tổng giám đốc Công ty Mopha) cùng bị đề nghị từ 4-5 năm tù.
Theo cáo trạng, Nguyễn Thị Thanh Nhàn đặt vấn đề và được Dương Hoa Xô đồng ý tạo điều kiện để Công ty AIC tham gia đấu thầu dự án mua sắm thiết bị 12 phòng thí nghiệm của Trung tâm Công nghệ sinh học TPHCM. Sau đó, các bị cáo đã thực hiện hàng loạt hành vi sai phạm trong đấu thầu để AIC trúng 8 gói thầu. Hành vi của các bị cáo gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 94,6 tỉ đồng.
Sau khi được bị cáo Dương Hoa Xô tạo điều kiện để trúng thầu, bị cáo Nhàn đã chỉ đạo cấp dưới đưa cho bị cáo Xô tổng cộng 14,4 tỉ đồng để cảm ơn. Hiện bị cáo Xô đã nộp lại toàn bộ số tiền này.
Ngoài vụ án này, cuối năm 2022, với vai trò là chủ mưu vụ án vi phạm quy định đấu thầu, đưa nhận hối lộ xảy ra ở Bệnh viện Đa khoa Đồng Nai, bị cáo Nhàn bị TAND Hà Nội phạt 30 năm tù. Tháng 10/2023, bị cáo Nhàn bị TAND Quảng Ninh tuyên phạm tội Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng, xử phạt 10 năm tù, trong sai phạm cung cấp thiết bị tại Bệnh viện Sản Nhi tỉnh.