Ban chỉ đạo do Phó Chủ tịch UBND TP Hải Phòng phụ trách lĩnh vực văn hóa - xã hội làm trưởng ban; Giám đốc Vườn quốc gia Cát Bà làm phó trưởng ban thường trực.
Ngoài ra, Ban chỉ đạo có 4 phó trưởng ban khác gồm: Chủ tịch UBND huyện Cát Hải, Giám đốc Sở Văn hóa và Thể thao, Giám đốc Sở Du lịch và Giám đốc Sở Nông nghiệp Phát triển nông thôn của TP Hải Phòng.
Các ủy viên còn lại gồm đại diện các Sở Nội vụ, Tài chính, Kế hoạch và Đầu tư, Thông tin và Truyền thông, Khoa học và Công nghệ, Tài nguyên và Môi trường, Ngoại vụ, Xây dựng, GTVT, Giáo dục và Đào tạo, Công an, Bộ chỉ huy quân sự, Bộ chỉ huy Bộ đội biên phòng TP Hải Phòng.
Ban chỉ đạo có chức năng chỉ đạo quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản (thuộc phạm vi quản lý của TP Hải Phòng).
Nhiệm vụ của Ban chỉ đạo là giúp UBND TP Hải Phòng điều phối hoạt động giữa các sở ngành, đơn vị, địa phương và các tổ chức, cá nhân liên quan trong công tác quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới.
Đồng thời, Ban Chỉ đạo giúp UBND TP Hải Phòng chỉ đạo việc xây dựng kế hoạch, tổ chức thực hiện các nhiệm vụ quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới; đề xuất xử lý, giải quyết các vấn đề phát sinh liên quan tới quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới.
Ban chỉ đạo cũng có nhiệm vụ chỉ đạo các hoạt động quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới; phối hợp Ban Quản lý vịnh Hạ Long thuộc UBND tỉnh Quảng Ninh để quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới hiệu quả, đúng quy định.
Ban chỉ đạo sẽ kiểm tra, hướng dẫn, đôn đốc các sở ngành, đơn vị, địa phương và các tổ chức cá nhân liên quan thực hiện chương trình, kế hoạch về quản lý, bảo vệ và phát huy giá trị di sản thiên nhiên thế giới, tổ chức sơ kết, tổng kết, thực hiện chế độ báo cáo định kỳ, đột xuất theo quy định.