Như phản ánh của The New York Times dẫn nguồn từ nhân viên cơ quan an ninh Ai Cập, trên khoang máy bay đã có những chữ vạch nguệch ngoạc "Chúng ta sẽ xé tan máy bay này".
Vết vạch xước đó có thể do bàn tay những nhân viên sân bay Cairo tán thành quan điểm của nhóm cực đoan "Anh em Hồi giáo". Tuy nhiên sau đó lời cảnh báo vẫn còn lại, người ta không sơn phủ đi.
Cũng được rõ là chiếc máy bay bị rơi có ba nhân viên an ninh tháp tùng, mặc dù thông thường trên khoang có hai vệ sĩ.
Cho đến thời điểm này, vẫn chưa rõ nguyên nhân nào gây ra thảm kịch với chiếc A320 chở 66 người là công dân của Pháp, Ai Cập, Canada và Vương quốc Anh.