Hoạt động bỏ phiếu trưng cầu dân ý chính thức bắt đầu lúc 8 giờ sáng giờ địa phương, nhưng xét theo tin kênh truyền hình Kurdistan24, một số khu vực, đặc biệt là ở Sulaymaniyah đã làm việc từ sớm. Các cử tri đến điểm bỏ phiếu, tìm tên mình trong danh sách và đặt dấu vân tay.
Trưng cầu dân ý diễn ra trong các trường học, bệnh viện, các cơ sở hành chính và công cộng.
Bỏ phiếu trực tuyến được tổ chức trên trang web riêng cho cử tri sống ở nước ngoài. Người đầu tiên thực hiện bỏ phiếu điện tử là một doanh nhân người Kurd sống ở Trung Quốc.
Ngày 25/9, Kurdistan Iraq tiến hành cuộc trưng cầu dân ý về độc lập mặc dù bị Baghdad và nhiều nước khác phản đối.