Việc giải thể được thực hiện sau khi hoàn tất chuyển giao chức năng, nhiệm vụ, nhân sự, tài chính và tài sản liên quan về các cơ quan chức năng. Quá trình chuyển giao dự kiến hoàn thành trước ngày 1/7.
Theo quyết định, các chức năng giám sát chung thị trường tài chính trong lĩnh vực chứng khoán và bảo hiểm, điều phối hoạt động giám sát thị trường tài chính quốc gia, giám sát hợp nhất các tập đoàn tài chính phi ngân hàng, tham mưu điều phối chính sách kinh tế - tài chính vĩ mô, cùng với việc xây dựng cơ sở dữ liệu giám sát, được chuyển giao về Bộ Tài chính.
Đối với chức năng giám sát chung thị trường tài chính trong lĩnh vực ngân hàng và giám sát hợp nhất các tập đoàn tài chính hoạt động trong lĩnh vực này, nhiệm vụ được chuyển về Ngân hàng Nhà nước Việt Nam.
Việc chuyển giao nhân sự cũng được quy định rõ. Theo đó, Bộ Tài chính tiếp nhận 51 cán bộ, Ngân hàng Nhà nước tiếp nhận 25 công chức, và Thanh tra Chính phủ tiếp nhận 4 lao động hợp đồng.
Toàn bộ tài sản công nghệ liên quan đến hệ thống thông tin giám sát thị trường tài chính cùng các tài sản hình thành từ dự án hỗ trợ kỹ thuật được chuyển về Bộ Tài chính để quản lý và sử dụng. Ngoài ra, các xe ô tô, thiết bị làm việc và hồ sơ tài liệu đã hoàn tất xử lý cũng được bàn giao theo đúng quy định.
Với những hồ sơ, tài liệu chưa giải quyết xong, Ủy ban Giám sát tài chính quốc gia sẽ chuyển giao cho Bộ Tài chính và Ngân hàng Nhà nước Việt Nam để tiếp tục theo dõi và xử lý. Hồ sơ liên quan đến nhân sự trong lĩnh vực chứng khoán và bảo hiểm sẽ do Bộ Tài chính quản lý, còn nhân sự liên quan đến giám sát ngân hàng sẽ được chuyển cho Ngân hàng Nhà nước. Hồ sơ tài liệu liên quan đến xe ô tô và lao động hợp đồng sẽ được bàn giao về Thanh tra Chính phủ.