Trước đó, các phương tiện truyền thông chính thức Uzbekistan thông báo rằng, Tổng thống Karimov đang chữa bệnh, đòi hỏi "một thời gian nhất định".
Vào tháng 3 năm 1990,ông Karimov được bầu làm tổng thống đầu tiên của nước Cộng hòa Liên bang. Năm 1991, ông thắng cử trong cuộc bầu tổng thống toàn quốc đầu tiên và bắt đầu nhiệm kỳ 5 năm lãnh đạo nước Uzbekistan độc lập.
Ông Karimov giữ vững cương vị trong hai cuộc trưng cầu dân ý vào năm 1995 và năm 2002, cũng như qua các cuộc bầu cử trực tiếp vào năm 2000, năm 2007 và năm 2015.