Nhà khoa học này bị kết án tù 7 năm. Do tính chất đặc biệt của cuộc điều tra, các tài liệu liên quan được xếp loại "bảo mật". Phiên tòa đã diễn ra ở chế độ không công khai.
Vào tháng 7 năm 2015, có tin ông Lapygin bị truy tố về tội phản quốc. Các nhà điều tra cho rằng, người này đã bán ra nước ngoài những thông tin bí mật. Nhà khoa học bị quản thúc tại nhà từ tháng 5 năm 2015.
